病虫害易发生以大豆为寄生的几种病害，如细菌性斑点病、黑斑病、立枯病、黄枯病等，在大豆重茬土壤中有适宜的发病条件，必然大量发生，尤其以线虫病危害严重。

　　根系微生物分泌物的毒害作用大豆根系能分泌某种呈酸性反应的物质，并形成一些有毒物质，如亚铁盐等，遗留在土壤中，使重茬大豆的正常营养代谢过程受到影响，根系发育不良，根瘤菌活动能力减弱，植株生育受到抑制，导致减产。

　　营养的过度消耗由于大豆重茬使土壤中磷素营养过度消耗，有效氮磷比例失调，影响大豆生育，因此，在大豆生产上要避免重茬，最好与其他作物实行三年以上的轮作制。