加入世贸组织以来，中国传统的农产品对外贸易由顺差变逆差，并呈现一直延续的趋势。专家分析认为，加入世贸组织后农产品进口品种数量增加、消费需求增加以及中国农产品国际竞争力仍较弱等是造成逆差的主要因素。 

    ２００４年中国农产品对外贸易首次出现逆差，全年逆差４８．８３亿美元，到２００５年逆差回落，缩小 
至１４．６４亿美元。

    但今年上半年中国农产品贸易逆差再次大幅增长。海关统计显示，上半年农产品进出口总额３０２．９亿美元，同比增长１５．６％，其中出口１４０．７亿美元，增长９．３％（去年同期为２２．５％）；进口１６２．２亿美元，同比增长２１．６％。上半年贸易逆差已达２１．５亿美元，超过去年全年规模。

    在外经贸大省广东，今年前１０个月农产品进出口贸易额达５３．７８亿美元，其中出口１９．６亿美元，与去年同期持平，进口３４．１８亿美元，比去年同期大幅增长了２０％，贸易逆差达到１４．６亿美元。

    中国食品土畜进出口商会副会长杨胜军２３日接受记者采访时说，加入世贸组织以来中国农产品贸易逆差，一个主要的因素就是根据加入世贸组织承诺，中国农产品的进口关税水平下降，农产品进口和销售无须通过国有企业和中介机构，逐步取消了对小麦等７类农产品的进口配额等。再加上在中国与东盟自由贸易框架下实施的农产品"零关税"计划，中国农产品进口的品种和数量大幅增加。

    其次，中国农业产业薄弱，农产品国际竞争力还较低，也正是由于农业产业薄弱，中国农产品出口才更容易遭受"绿色壁垒"的限制。加入世贸组织以来，受制于各种各样的"绿色壁垒"，中国农产品遭欧美日韩等国海关退运的事件层出不穷，而今年五月开始日本实施的"肯定列表制度"又设置了更为严格的农药残留标准，几乎涵盖中国对日出口的所有农产品，使中国农产品出口雪上加霜。

    另外，从消费层次来看，随着中国人民生活水平的提高，消费能力增强，购买优质的进口水果、食品的强大需求也带动了进口的迅速增长。专家认为，中国水资源紧缺，土地的使用强度很高，进口国外的农产品有利于缓解资源方面的压力。

    农产品贸易逆差还与中国的贸易方式有关。由于加工贸易在中国对外贸易中占据重要比重，许多农产品是作为工厂的原材料进口的，但出口时却是以工业制成品出口，如进口的是棉花，而出口的则是衣料、服装。